1-Halobacteriumlarda bacteriorhodopsin (mor renkli) adlı ışığa duyarlı rengini ve kimyasal enerjisini sağladığı pigment içerir. Bacteriorhodopsin hücre zarının dış kısmına proton pompalar. protonların geri akışı hücrenin enerji kaynağı olan ATP sentezinde kullanılmaktadır
2- Çoğu arkae tRNA ve rRNA genlerinde arkaelere has intronlar bulunur ki bunlar ve eukaryotik intronlara ne de bakteriyel intronlara benzer.
3- Bakteri ribozomları bazı kimyasal inhibitörlere duyarlıdır ancak arkae bakteri ve eukaryotik ribozomlar bu maddelere duyarlı değildir. Bu özellik Arkae ve eukaryot arasında yakın bir ilişki olduğunu gösterir.
4-Moleküler biyolojide temel rolü olan genetik transkripsiyon ve translasyon mekanizmaları bakterilere pek benzemeyip çoğu bakımdan ökaryotlara benzemektedir. Örneğin arke translasyonu eukaryotik benzeri başlatma ve uzatma faktörleri kullanır transkripsiyonda eukaryotlardaki gibi TATA-bağlanma proteinleri rol oynar.
5-Tüm bakteri hücre duvarlarının kimyasal yapısı peptidoglzarı iki DNA yı ve sitoplazmayı ikiye ayırır ve organizma iki yeni hücreye bölünür. Bazı türler her 20 dakikada bir bölünür.Eşeyli üreme görülmez.
